Manche sehr sehr billigen Mainboards aus der Abteilung "hauptsache billig" halten die Spannungen nicht immer sauber und sind daher nicht immer in der Lage vollkommenes ausreizen des Leistungspotenzials der anderen Komponenten zu garantieren.
Teure Mainboards machen das manchmal, nur eben nicht immer, besser.
Mal abgesehen davon dass irgendwo am unteren Ende der Preisspanne auch an der Verarbeitung gespart wird und man dann gelegentlich schon mal wackelicke Anschlüsse oder schlechtere Layouts (man kommt eben nicht bei jedem Mainboard an alle internen Anschlüsse gleich gut ran) erhält.
Und dann gibts natürlich noch zusätzliche Features, das geht bei der Ausgestaltung der Kühlkörper los, setzt sich mit fest eingebauten Power- und Resetknöpfen (sehr praktisch für Board-auf-Karton-Situationen) fort und endet z.B. bei Status-Displays die einem mit einem zweistelligen Code den Arbeitszustand des Mainboards anzeigen - was vor allem zur Fehlersuche hilfreich ist wenn man z.B. die Leistungsgrenzen der Hardware maximal herausfordern will.