Ein kleiner Geschwindigkeitsvorteil kommt eher zu Stande, wenn Die Auslagerungsdatei eine eigene Partition, die dann aber aber am Anfang der Platte liegen muss, bekommt.
Der entsteht Dir dann dadurch, dass schneller positioniert werden kann, und nicht immer erst "Lücken gestopft" werden. Hast also Deine Auslagerungsdatei immer schön am Stück. Kann also etwas schneller geschrieben und gelesen werden, als wenn sie in unzähligen Fragmenten über die Platte verteilt ist.
Nun denke aber mal nicht, dass der Vorteil gewaltig wäre. Er ist manchmal sogar so klein, dass da überhaupt nichts spürbar ist.
Ansonsten ist's halt doch 'ne Frage der Übersichtlichkeit und Sicherheit.
Auch wenn Programme und Anwendungsdaten weitere Parttitionen bekommen, sollte man (regelmässig) Backups (aller Partitionen) machen, sofern man das platzmässig irgendwie in den Griff bekommt.