Du könntest es im Linux mit "egrep" oder "grep" versuchen. Du kannst es auch mit "find" oder "hexdump" kombinieren, falls Du mehr Funktionalität benötigst.
Du kannst Linux von einer Live-CD starten, ohne es installieren zu müssen.
Desweiteren könntest Du die betroffenen Dateien, z.B. mit einem Script, zu einer großen zusammenkopieren, wenn Du eine bestimmte herauspicken willst, dann kannst Du die Dateiinhalte in der großen Datei mit ihren Dateinamen trennen. Wenn Du dann mit Deinem HexEditor drin suchst und das Y findest, kannst Du bis zum letzten Dateinamen zurücksppringen und weisst, in welcher Datei es steht.
Das mit dem "Y" habe ich nicht kapiert. Benutzt Du "Y" hier als Variable oder glaubst Du, "Y" bestünde tatsächlich nur aus Nullen? ("Y" ist bei mir 0a59 in Hex und das sind in Binär natürlich ebenfalls nicht nur Nullen, aber was "Y" ist, kommt u.U. auf den verwendeten Zeichensatz an.)