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Du könntest höchstens mit einem Programm auf dem Windows PC regelmäßig Dateien in zB eine Samba-Freigabe auf dem Server verschieben.
Oder andersrum eine Windows Ordnerfreigabe regelmäßig mit Linux sichern (macht aber natürlich nur bei einer Hand voll Freigaben Sinn). Noch möglich wäre ein komplettes Laufwerk im Netzwerk freizugeben und dann sichern: