In Sachen Performance ists vollkommenst egal.
Ob eSATA oder USB 3.0, ists immer die Festplatte selbst, die bestimmt wie schnell Daten gelesen oder geschrieben werden.
Ansonsten kann es zuweilen, dies hängt vom Controller im Gehäuse der Externen ab, etwas vorteilhafter sein auf eSATA zu setzen.
Damit verhält sich die Platte exakt wie ein interner Massenspeicher.
Manche USB-Controller reichen den Ausschalt-Impuls nicht an die Platte weiter, wodurch das Zeitmanagement seitens des Betriebssystems nicht zufriedenstellend funktioniert.
Aber das ist die Ausnahme ...