Den 3,5-Anschluß ist für die inzwischen eher selten anzutreffenden FloppyDisk-Laufwerke gedacht. (Noch seltener natürlich LS120-Laufwerke oder IOMEGA-ZipDrives.)
SATA für Massenspeicher nach dem SATA-Standard (neue Festplatten und opt. Laufwerke).
PCIe für die Graka. Achtung! Viele heutige Grafikboliden brauchen zwei davon.
An 5,25-Anschlüsse, die allgemein als Molex bezeichnet werden, kannst Du ältere Festplatten und opt. Laufwerke, die noch dem IDE-Standard angehören, anschließen.
Hier werden aber auch (meist mit einem Molex-Adapter) zusätzliche Gehäuselüfter bzw. Lüftersteuerungen, die Inverter für KK und andere, eine 12Volt-Versorgungsspannung benötigende, Verbraucher angeschlossen.
(Meß- und Datenlogger-Karten, Schrittmotorsteuerungen etc.)