Das Aussägen von Kreisen würde ich so auch machen, ist glaub ich auch allgemein üblich. Zur Not kann man sich auch noch irgendwo ein Lochblech besorgen und als Gitter dazwischenlegen, damit die Rotoren nicht so frei liegen.
Man müsste dann natürlich im Plexi entsprechende Löcher bohren, die größer sind als der gesamte Schraubenquerschnitt mit Gewinde, sonst lutscht man ja ständig die Scheibe mit aus, wenn man einen Lüfter anschraubt. Eventuell gibt es auch irgendwo Lüfter mit metrischem Gewindeeinsätzen in den Befestigungslöchern zu kaufen... ich weiß zumindest, dass bei meinem LianLi Gehäuse mal so welche dabei waren, die man mit normal metrischen Schrauben befestigen konnte. Eventuell bedarf es dabei auch einigen Unterlegscheiben auf der Plexiglas-Seite oder man nimmt Senkschrauben und bereitet die Bohrlöcher entsprechend vor.